O Penarol-Am foi fundado em 08 de agosto de 1947.Por um grupo de amigos entre eles Luis Calheiros Gama,Laureano Seixas,José Lemos De Abreu e Sebastião Mestrinho.O clube foi fundado com esse nome em homenagem ao grande Peñarol do Paraguai,famoso nos anos cinquenta.
Em 1980 o Clube disputou o seu primeiro Campeonato Amazonense de Futebol, seguindo na disputa ininterruptamente até 1989, depois disputou em 1991 e 1993, daí só retornando em 2007 via Série B do amazonense, do qual foi Vice-campeão em 2008, quando ascendeu à elite do futebol amazonense, e já em 2010 sagra-se Campeão Amazonense, conquistando com isso o direito de representar o Amazonas na Copa do Brasil 2011 contra o Paysandu do Pará, com quem travou uma acirrada disputa, tendo sido eliminado após uma derrota (2x3) em Itacoatiara e empate (2x2) em Belém e Campeonato Brasileiro Série D – 2011, que começa em julho. Sendo este o nosso grande objetivo do presente. Já que este ano conseguimos o Bicampeonato em disputa acirrada com Nacional de Manaus.
Primeiros campeonatos
O Penarol filiou-se à Federação Amazonense de Futebol para disputar o campeonato profissional de 1980.
A estreia aconteceu no dia 1º.de agosto desse ano, no estádio “Floro Mendonça”, em Itacoatiara. O Penarol empatou com o Libermorro, da capital, em 1 a 1.
Penarol:
Ariril, Nunes, Zé Arlindo, Idário e Paulo Afonso; Carioca, Farias e Hamilton; Lôla, Índio (Marcelo) e Eraldo. Técnico: Carlos Moraes.
Libermorro:
Edmundo, Lauro (Zé Carlos), Maciel, Valdir e Hilton; Júlio Cezar e Evandro; Celio, Silva, Janilson e Roberto.
O jogo apitado por Geraldino Cruz, auxiliado por Rosquilde Serra e Antônio Vaz Cerquinho.
O Penarol foi o primeiro clube do interior a participar do Campeonato Amazonense, apesar de fundado em 1947, o primeiro Campeonato Amazonense de Futebol que disputou foi em 1980 e jogou seguidamente até 1989 e os anos de 1991 e 1993.
Retorno ao profissionalismo
Em 2006, o Fast Clube, time tradicional de Manaus, resolve mandar seus jogos no município de Itacoatiara e chega ao vice-campeonato, com isso muita gente pede a volta do clube original e tradicional de Itacoatiara, pois o Fast era originalmente de Manaus e isso desagradava boa parte da população daquele município.
Série B do Amazonense 2007
Com o sucesso do Fast Clube e com a volta do Campeonato Amazonense de Futebol - Segunda Divisão, o clube volta ao profissionalismo em 2007, estreando em Itacoatiara no Estádio Floro de Mendonça contra o Holanda, perdendo por 1x0.
No primeiro Turno ficou em segundo lugar, atrás somente do Holanda, a campanha do primeiro turno foi a seguinte:
21/10/2007 Penarol 0-1 Holanda
25/10/2007 Penarol 6-1 Olímpico
31/10/2007 Penarol 1-1 Nacional-B
04/11/2007 Penarol 4-4 Nilton Lins
07/11/2007 Penarol 3-2 CEPE Iranduba
11/11/2007 Penarol 2-0 CDC Manicoré
No segundo Turno a equipe caiu de produção e obteve a seguinte campanha, ficando em penúltimo lugar:
17/11/2007 Penarol 1-1 Holanda
22/11/2007 Penarol 2-1 Olímpico
28/11/2007 Penarol 1-3 Nacional-B
02/12/2007 Penarol 2-5 Nilton Lins
05/12/2007 Penarol 2-2 CEPE Iranduba
09/12/2007 Penarol 2-3 CDC Manicoré
No geral a equipe foi o 5º colocado no campeonato Amazonense da Serie B2007 que marcava a volta da equipe aos Campos profissionais.
Serie B de 2008 e o acesso
No ano de 2008 a equipe consegue o vice-campeonato e ascende para a 1ª divisão do Campeonato Amazonense de Futebol de 2009 com os seguintes números;
1° Turno foi 3° colocado:
31/08/2008 Penarol 0-0 Tarumã
07/09/2008 Penarol 3-4 Rio Negro
14/09/2008 Penarol 5-0 Libermorro
21/09/2008 Penarol 2-1 São Raimundo-B
01/10/2008 Penarol 1-0 Manicoré
11/10/2008 Penarol 3-1 Nilton Lins
2° Turno foi vice-campeão:
19/10/2008 Penarol 1-1 Tarumã
26/10/2008 Penarol 0-1 Rio Negro
30/11/2008 Penarol 6-0 Libermorro
08/11/2008 Penarol 2-1 São Raimundo-B
23/11/2008 Penarol 2-0 Manicoré
30/11/2008 Penarol 3-2 Nilton Lins
No Geral a equipe foi vice-campeã e garantiu vaga na Serie A ao lado do Rio Negro e do CDC Manicoré.
A volta a Elite do Futebol Amazonense
Em 2009, na sua volta à primeira divisão amazonense, faz uma boa campanha no primeiro turno, só que prejudicado com a formula de disputa do segundo turno o clube caiu de produção e no geral ficou na 5º colocação entre dez times, com 21 pontos ganhos.
2010 - Campeão Amazonense
Em 2010, três anos após seu retorno ao profissionalismo, o Leão da Velha Serpa faz indiscutivelmente, a melhor campanha dentre todos os 10 clubes participantes, culminando com o título amazonense conquistado em cima do Fast Clube ganhando os dois jogos da decisão por 1 a 0 e aumentando ainda mais o jejum do Tricolor de Aço, que agora amarga 40 anos sem título. Esse foi o primeiro título amazonense do clube de Itacoatiara em 63 anos de história. A conquista deu direito ao Penarol de disputar a Copa do Brasil 2011 e a Série D 2011.
Títulos Estaduais
Campeonato Amazonense: 2 vez (2010 e 2011)
Torneio Início: 1 vez (1988)